Testei várias linguagens de programação: python, php, C#, java, ..., mas recomendo o uso da linguagem Ruby para uso da pesquisa in silico e outras finalidades. Portanto, recomendo acessarem os links:
- Aprenda a programar: http://www.jmonteiro.com/aprendaaprogramar/ contribuição de Júlio Santos Monteiro
- Site oficial da linguagem Ruby: https://www.ruby-lang.org/en/ e https://www.ruby-lang.org/pt/
- Testar o Ruby sem instalar: http://tryruby.org
- Pacote para bioinformática - BioRuby: http://bioruby.org/
Recomendo os vídeos no canal do youtube do Jackson Pires Curso de Ruby on Rails e o curso na Udemy ainda tenho alguns cupons com 50% de desconto. Estou fazendo esse curso e caso alguém tenha dúvidas, pode comentar aqui ou mandar e-mail infopontes@gmail.com .